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系統性文獻搜尋、篩選、下載、整理。觸發：文獻回顧、找論文、搜尋文獻、systematic review、literature search、PubMed、找文章、搜paper、review、reference、citation、引用、參考文獻、背景調查、background。

⭐3stars🔀0forks📁View on GitHub🕐Updated Dec 22, 2025
[Academic Research]

When & Why to Use This Skill

This Claude skill automates the systematic literature review process by integrating with PubMed to search, filter, and organize academic papers. It features advanced capabilities such as PICO clinical question parsing, citation metric analysis (RCR), and automated reference management, significantly accelerating evidence-based research and background investigations.

Use Cases

  • Systematic Reviews: Automating comprehensive literature searches across PubMed using MeSH terms and Boolean operators to ensure high recall and precision.
  • Clinical Question Answering: Utilizing the PICO framework to break down complex medical queries and retrieve targeted evidence-based results.
  • Citation Network Exploration: Performing forward and backward citation searches to discover related studies and track the evolution of specific research topics.
  • Research Impact Evaluation: Sorting and prioritizing literature based on citation metrics like the Relative Citation Ratio (RCR) to identify high-impact papers.
  • Reference Management: Organizing discovered papers into structured formats and exporting them as RIS, BibTeX, or CSV files for use in citation software.
nameliterature-review
description系統性文獻搜尋、篩選、下載、整理。觸發：文獻回顧、找論文、搜尋文獻、systematic review、literature search、PubMed、找文章、搜paper、review、reference、citation、引用、參考文獻、背景調查、background。

系統性文獻回顧

適用情境

  • 開始新研究專案 | 撰寫 Introduction 前調查 | 系統性回顧 | PICO 臨床問題
  • 不適用：快速查一篇 → 直接 search_literature | 只需整理 → format_references

工具速查

pubmed-search MCP

類別 工具 說明
搜尋 search_literature 基本 PubMed 搜尋
generate_search_queries MeSH + 同義詞材料
parse_pico 解析 PICO 臨床問題
merge_search_results 合併去重
探索 find_related_articles 相似文章
find_citing_articles 引用此文的後續研究
get_article_references 此文的參考文獻
get_citation_metrics iCite RCR 指標
Session get_session_pmids 取回搜尋結果 PMID
get_session_summary 查看 session 狀態
匯出 prepare_export RIS/BibTeX/CSV
analyze_fulltext_access PMC 全文可用性

mdpaper MCP 儲存文獻

方法 優先級 說明
save_reference_mcp(pmid) PRIMARY ✅ MCP-to-MCP 驗證
save_reference(article) FALLBACK ⚠️ 僅當 API 不可用 
✅ save_reference_mcp(pmid="12345678", agent_notes="...")
❌ save_reference(article={metadata})  # Agent 可能幻覺

工作流程

Phase 0: 環境準備

get_current_project()  # 確認專案
讀取：projects/{slug}/.memory/activeContext.md  # 了解之前做了什麼

Phase 1: 建立搜尋策略

關鍵字搜尋（一般主題）：

generate_search_queries(topic="remimazolam sedation ICU", strategy="comprehensive")

PICO 搜尋（比較性問題）：

# Step 1: 解析 PICO
parse_pico(description="remimazolam 在 ICU 鎮靜比 propofol 好嗎？")
→ P=ICU patients, I=remimazolam, C=propofol, O=sedation

# Step 2: 並行取得各元素 MeSH（同時呼叫！）
generate_search_queries(topic="ICU patients")
generate_search_queries(topic="remimazolam")
generate_search_queries(topic="propofol")

Phase 2: 並行搜尋執行

# 同時多組搜尋（並行呼叫！）
search_literature(query='"Intensive Care Units"[MeSH] AND remimazolam', limit=50)
search_literature(query='remimazolam AND propofol AND sedation', limit=50)

# 合併結果
merge_search_results(results_json='[{"query_id": "q1", "pmids": ["123"]}, ...]')

Phase 3: 結果評估

# 結果太少 (<20) → 擴展
expand_search_queries(topic="...", current_results=15)

# 對種子文獻做引用網路探索
find_citing_articles(pmid="12345678")   # forward
find_related_articles(pmid="12345678")  # similar
get_article_references(pmid="12345678") # backward

# 取得引用指標排序
get_citation_metrics(pmids="last", sort_by="relative_citation_ratio", min_rcr=1.0)

Phase 4: 篩選與儲存

# 呈現篩選清單給用戶（標題、年份、期刊、RCR）

# ✅ PRIMARY：使用 MCP-to-MCP 驗證
save_reference_mcp(pmid="12345678", agent_notes="Key paper on...")

# ⚠️ FALLBACK：僅當 API 不可用
save_reference(article={metadata}, project="...")

Phase 5: 匯出

format_references(style="vancouver")
prepare_export(pmids="last", format="ris")
analyze_fulltext_access(pmids="last")

Phase 6: ⭐ 更新專案記憶

# 必須更新！
寫入：projects/{slug}/.memory/activeContext.md
- Current Focus: 文獻回顧進度
- Key References: 關鍵文獻及重要性
- Memo / Notes: Agent 對文獻的觀察

決策點

時機 選擇
建立專案 or 探索？ 先探索熟悉文獻
關鍵字 or PICO？ 比較性問題用 PICO
結果數量 50-300 繼續，<20 擴展，>500 限縮
篩選方式 <30 逐篇，>30 用 RCR 排序

常見問題

問題 解法
結果太多 加 MeSH、article_type、縮小年份
結果太少 expand_search_queries、移除 Comparator
用哪個儲存？ 永遠優先 save_reference_mcp
Session 用途？ get_session_pmids(-1) 取回最近搜尋

相關技能

  • concept-development - 發展研究概念
  • parallel-search - 並行搜尋細節